喷雾干燥过程可以是分批的或连续的，这取决于生产需要和待喷雾干燥的溶液的稳定性。由于减少了产品操作，可以减少微生物和颗粒负担。通常存在溶液容器，具有预滤器和无菌过滤器的过滤系统，以及以受控速率供给喷雾干燥器的压力容器，喷雾干燥器本身和散装容器。
  
  用于产品干燥的空气应进行HEPA过滤。当使用硅树脂垫圈设计时，该系统将承受灭菌温度。雾化装置可以是喷嘴或高速离心装置。
  
  喷雾干燥的产品通常对温度敏感，因此，应控制空气温度并尽可能低。雾化装置的设计应确保产品不会粘附在容器壁上。表面干燥和去除热原可以在连续操作的隧道或分批烘箱中进行。前一种方法是优选的，因为它使加载过程中颗粒污染的可能性更小化。